Бесплатная многопоточность в BLAST

Ключ " -a #num_CPU" включает многопоточность в standalone BLAST

Не знаю, как вы, а я был приятно удивлен, когда обнаружил что stand-alone BLAST под Windows уже умеет быть многопоточным. Сейчас, когда практически у каждого есть как минимум двухядерный процессор, чтобы задействовать его на полную мощность всегда добавляйте "-a 2" к командной строке любого поиска standalone BLAST.