Биотехнология: современное состояние и перспективы

Предварительная программа секции «Биоинформатика» Пятого Московского международного конгресса «Биотехнология: современное состояние и перспективы»

Устные доклады (17 марта 2009 года, 9:30 – 18:00):

 

09:30-10:00

Гельфанд M.С. Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича РАН, Москва, Россия

СРАВНИТЕЛЬНАЯ ГЕНОМИКА БАКТЕРИЙ КАК ИНСТРУМЕНТ ДЛЯ БИОТЕХНОЛОГИИ

10:00-10:25

Лихошвай В.А. Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия

МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ И КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ ГЕННЫХ СЕТЕЙ

10:25-10:50

Боярских У., Филипенко М., Глух А., Кель А. Институт химической биологии и фундаментальной медицины, СО РАН, г. Новосибирск, Россия; BIOBASE GmbH, Вольфенбюттель, Германия

СИСТЕМНАЯ БИОЛОГИЯ В ПРАКТИКЕ. ПОИСК МЕХАНИЗМОВ СУПРЕССИИ ОПУХОЛЕЙ

10:50-11:15

Козлов К.Н., Самсонов А.М. Отдел компьютерной биологии, Государственный Политехнический Университет; ФТИ им. Иоффе РАН, Санкт-Петербург, Россия

МЕТОД РАЗНОСТНОЙ ЭВОЛЮЦИИ ДЛЯ ПОСТРОЕНИЯ ГЕННЫХ РЕГУЛЯТОРНЫХ СЕТЕЙ

11:15-11:40

Любецкий В.А., Селиверстов А.В. Учреждение Российской академии наук Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича РАН, Москва, Россия

РЕГУЛЯЦИЯ ЭКСПРЕССИИ ПЛАСТИДНЫХ БЕЛКОВ У ПАРАЗИТОВ, ВОДОРОСЛЕЙ И РАСТЕНИЙ

11:40-12:00

Кофе-брейк

12:00-12:25

Самсонова M., Mану, Суркова С., Райниц Д. Санкт-Петербургский государственный университет, 29, Политехническая ул., Санкт-Петербург, Россия; Университет Стони Брука, Стони-Брук, США

КАНАЛИЗАЦИЯ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ В БЛАСТОДЕРМЕ ДРОЗОФИЛЫ

12:25-12:50

Матушкин Ю.Г., Ефимов В.М., Лихошвай В.А., Левицкий В.Г. Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия

ИССЛЕДОВАНИЕ ЭФФЕКТИВНОСТИ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ В ЗАВИСИМОСТИ ОТ ИХ НУКЛЕОТИДНОГО СОСТАВА МЕТОДАМИ БИОИНФОРМАТИКИ

12:50-13:15

Мясникова Е.М., Козлов К.Н., Писарев А.С., Самсонова М.Г. С-Петербургский государственный политехнический университет, С-Петербург, Россия

МЕТОДЫ ПОЛУЧЕНИЯ ВЫСОКОТОЧНОЙ КОЛИЧЕСТВЕННОЙ ИНФОРМАЦИИ ОБ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ  ИЗ КОНФОКАЛЬНЫХ ИЗОБРАЖЕНИЙ

13:15-13:40

Ефимов В.М., Катохин А.В. Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия

МНОГОМЕРНЫЕ МЕТОДЫ МУЛЬТИПЛАТФОРМЕННОЙ ОБРАБОТКИ МИКРОЧИПОВЫХ ЭКСПРЕССИОННЫХ ДАННЫХ

13:40-14:05

Туманян В.Г., Филатов И.В., Мильчевский Ю.В., Намиот В.А., Есипова Н.Г. Учреждение Российской академии наук Институт молекулярной биологии им.В.А.Энгельгардта РАН; Институт ядерной физики Московского государственного университета им. М.В.Ломоносова, Москва, Россия

СТРУКТУРОБРАЗУЮЩИЕ БЕЛКИ ГРУППЫ КОЛЛАГЕНА. БИОТЕХНОЛОГИЧЕСКИЕ ПЕРСПЕКТИВЫ

14:05-15:00

Кофе-брейк

15:00-15:25

Лисица А.В. Институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН, Москва, Россия

ПРОТЕОТИПИРОВАНИЕ - АЛГОРИТМ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКИ ДЕТЕРМИНИРОВАННОГО ПОЛИМОРФИЗМА БЕЛКОВ

15:25-15:50

Соболев Б.Н., Александров К.Е., Филимонов Д.А., Поройков В.В. НИИ Биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН, Москва, Россия

РАСПОЗНАВАНИЕ ФУНКЦИОНАЛЬНЫХ КЛАССОВ БЕЛКОВ НА ОСНОВЕ ЛОКАЛЬНОГО СХОДСТВА АМИНОКИСЛОТНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

15:50-16:15

Веселовский А.В., Институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН, Москва, Россия

МОЛЕКУЛЯРНЫЙ ДОКИНГ: УСПЕХИ И ПРОБЛЕМЫ

16:15-16:40

Строганов О.В., Новиков Ф.Н., Стройлов В.С., Чилов Г.Г. ООО «Молекулярные Технологии», Москва, Россия

LEAD FINDER - ПРОГРАММНЫЙ ПРОДУКТ ДЛЯ ПОИСКА НОВЫХ ЛЕКАРСТВЕННЫХ ПРЕПАРАТОВ

16:40-17:05

Иванисенко В.А., Деменков П.С., Подколодный Н.Л., Иванисенко Т.В., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А. Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия

НАНОБИОТЕХНОЛОГИЯ: ИЗВЛЕЧЕНИЕ ЗНАНИЙ МЕТОДАМИ TEXT-MINING

17:05-17:30

Поройков В.В., Арчаков А.И. Институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича РАМН, Москва, Россия

РУБРИКАТОР ПО БИОИНФОРМАТИКЕ

17:30-18:00

Дискуссия

 

 

 

Preliminary Program of the Section "Bioinformatics"

of the Fifth Moscow International Congress "Biotechnology: State of the Art

and Prospects of Development"

 

Oral presentations (March 17, 2009, 9:30 - 18:00):

 

09:30-10:00

Mikhail Gelfand. Institute for Information Transmission Problems (Kharkevich Institute) of Rus. Acad. Sci., Moscow, Russia

COMPARATIVE GENOMICS OF BACTERIA AS A TOOL FOR BIOTECHNOLOGY

10:00-10:25

Vitaly Likhoshvai. Institute of Cytology and Genetics of SB RAS, Novosibirsk, Russia

THE MATHEMATICAL MODELING AND COMPUTER ANALYSIS OF GENE NETWORKS

10:25-10:50

Ulyana Boyarskih, Maxim Philipenko, Angela Gluch,  Alexander Kel. Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, Novosibirsk, Russia; BIOBASE GmbH, Wolfenbuettel, Germany

APPLIED SYSTEMS BIOLOGY. IDENTIFICATION OF MECHANISMS OF TUMOR SUPPRESSION

10:50-11:15

Kozlov K.N., Samsonov A.M.

State Polytechnical University; A.F. Ioffe PTI of RAS, St.Petersburg, Russia

DIFFERENTIAL EVOLUTION FOR CONSTRUCTION OF GENE REGULATORY NETWORKS

11:15-11:40

Lyubetsky V.A., Seleverstov A.V. Institute for Information Transmission Problems RAS (Kharkevich institute), Moscow, Russia

EXPRESSION REGULATION OF PLASTID PROTEINS IN PARASITES, ALGAE AND PLANTS

11:40-12:00

Coffee-Break

12:00-12:25

Samsonova M., Manu, Surkova S., Reinitz J. St. Petersburg State Polytechnical University, St.Petersburg, Russia; Stony Brook University, Stony Brook, USA.

CANALIZATION OF GENE EXPRESSION IN THE DROSOPHILA BLASTODERM

12:25-12:50

Matushkin Yu.G., Efimov. V.M., Likhoshvai V.A., Levitskiy V.G. Institute of Cytology and Genetics of SB RAS, Novosibirsk, Russia

STUDY OF GENE EXPRESSION EFFICIENCY IN RELATION TO THEIR NUCLEOTIDE CONTENTS BY BIOINFORMATICS METHODS

12:50-13:15

Myasnikova E.M., Kozlov K.N., Pisarev A.S., Samsonova M.G. St. Petersburg State Polytechnical University, St.Petersburg, Russia,

METHODS FOR THE ACQUISITION OF HIGH-PRECISION QUANTITATIVE INFORMATION ON GENE EXPRESSION FROM CONFOCAL IMAGES

13:15-13:40

V.M. Efimov, A.V. Katokhin. Institute of Cytology and Genetics of SB RAS, Novosibirsk, Russia

MULTIDIMENSIONAL METHODS OF MULTIPLATFORM RETRIEVAL OF MICROCHIPS EXPRESSION DATA

13:40-14:05

Tumanyan V.G., Filatov I.V., Milchevsky Yu.V., Namiot V.A., Esipova N.G. Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences; Institute of Nuclear Physics, Lomonosov Moscow State University, Moscow, Russia

STRUCTURE-FORMING PROTEINS OF COLLAGEN GROUP. BIOTECHNOLOGICAL ASPECTS

14:05-15:00

Coffee-Break

15:00-15:25

Andrey Lisitsa. Institute of Biomedical Chemistry of Rus. Acad. Med. Sci., Moscow, Russia

PROTEOTYPING - ALGORITHM FOR DETERMINATION OF GENE-CENTRIC PROTEINS POLYMORPHISM

15:25-15:50

Sobolev B.N., Alexandrov K.E., Filimonov D.A., Poroikov V.V. Institute of Biomedical Chemistry, Russian Academy of Medical Science, Moscow, Russia

RECOGNITION OF PROTEIN FUNCTIONAL CLASSES BASED ON THE LOCAL SIMILARITY OF AMINO ACID SEQUENCES

15:50-16:15

Alexander Veselovsky. Institute of Biomedical Chemistry of Rus. Acad. Med. Sci., Moscow, Russia

MOLECULAR DOCKING: SUCCESSES AND PROBLEMS

16:15-16:40

Stroganov O.V., Novikov F.N., Stroylov V.S., Chilov G.G. Molecular Technologies, Ltd, Moscow, Russia

LEAD FINDER - SOFTWARE FOR DRUG DISCOVERY APPLICATIONS

 

16:40-17:05

Ivanisenko V.A., Demenkov P.S., Podkolodniy N.L., Ivanisenko T.V., Khlebodarova T.M., Kolchanov N.A. Institute of Cytology and Genetics SB RAS, Novosibirsk, Russia

NANOBIOTECHNOLOGY: KNOWLEDGE EXTRACTION USING TEXT-MINING

17:05-17:30

Poroikov V.V., Archakov A.I. Institute of Biomedical Chemistry of Rus. Acad. Med. Sci., Moscow, Russia

BIOINFORMATICS RUBRICATOR

17:30-18:00

Discussion