Новости

Новости сайта.

Московский семинар по биоинформатике - 13 марта 2014

Автор: Administrator

Четверг, 13 марта 2014, 18.00
МГУ, лаб. корпус Б (факультет биоинженерии и биоинформатики), к. 221.


Инна Дубчак
Lawrence Berkeley National Laboratory

Visualization of genomic data: results, challenges, and open questions

As our ability to generate huge amounts of sequencing data continues to increase, data analysis is becoming the rate-limiting step in genomics studies. Visualization tools facilitate analysis tasks by enabling researchers to explore, interpret and manipulate their data. There are a number of graphical methods designed for the analysis of de novo sequencing assemblies and read alignments, genome browsing, comparative genomics, etc. All available visualization tools have their strengths and limitations.
We will highlight new challenges in visualization that are not only a consequence of the sheer volume and complexity of genomic data, but also its increasing utility outside genomics research. Traditional genome visualization approaches do not meet the needs of emerging fields such as medical genomics and metagenomics, and new paradigms are needed. Clinicians require efficient presentation of critical information in order to form a diagnosis, and biobanks and population studies produce detailed phenotype descriptions too complex to represent as a heat map or other form of tabular visualization. These data can reveal the effect of spatial and environmental factors on population and ecosystem structure, but interactive, extensible, easy to use tools must be provided to enable their analysis and exploration.

 

Московский семинар по биоинформатике - 1 июля 2013

Автор: Administrator

Понедельник, 1 июля 2013, 18.00
МГУ, Лаб. корпус Б (факультет биоинженерии и биоинформатики), к. 221.


E. Kolker
Seattle Children's Research Institute

Proteomes in Profile

These days, large volumes of high-throughput mass spectrometry proteomics studies are routinely conducted. The studies are ultimately aimed at better understanding biological processes by studying proteomes' profiles. However, the size and complexity of proteomics data hinders efforts to easily share, integrate, query, and compare such profiles. We will overview our recent developments addressing these challenges, including the creation of MOPED (Model Organism Protein Expression Database, moped.proteinspire.org). MOPED focuses on answering four fundamental questions:
1. Which proteins are identified and where (organisms, tissues, localizations, pathways)?
2. How much of each protein is identified (relative and absolute expression)?
3. How does the knowledge of your current experiment compare to existing information?
4. How does this knowledge guide your next (experimental or computational) study?

 

Московская школа Биоинформатики - набор на новый 2013/2014 учебный год открыт

Автор: Administrator

Московская школа Биоинформатики рада Вам сообщить, что набор на новый 2013/2014 учебный год состоится!

Новый набор будет рассчитан на студентов и выпускников биологических специальностей (допускаются лица других направлений, хорошо знающих курс биологии, читаемый на старших курсах биологических факультетов). Поступление в Школу состоит из двух этапов: заочного он-лайн тестирования по биологии (программа экзамена будет вывешена позже) и очного устного экзамена- собеседования. Лица, успешно написавшие экзамен и прошедшие собеседование будут зачислены в Школу Биоинформатики. Все вступительные испытания будут проводиться в конце июня.

Мы рассматриваем также возможность организации потока для коллег с математическим образованием, но пока не ясно, получится ли. Если да, будет объявлен дополнительный прием в июле-августе. Следите за объявлениями!

Обучение в Школе бесплатное, вечернее. Срок обучения – 2 года. Все вопросы о Школе вы можете задать по адресу: Этот e-mail адрес защищен от спам-ботов, для его просмотра у Вас должен быть включен Javascript

Информация о читаемых в нашей школе курсах доступна здесь: Читаемые курсы Школы Биоинформатики.docx

Ссылка на исходное объявление - http://bioinformaticseminar.com/ru/wiki/new/


   

Московский семинар по биоинформатике - 21 марта 2013

Автор: Administrator

Четверг, 21 марта 2013, 18.00
МГУ, Лаб. корпус Б (факультет биоинженерии и биоинформатики), к. 221.

Prof. Dr. Edgar Wingender
University Medical Center Goettingen and geneXplain GmbH, Germany

Constructions and analysis of gene regulatory networks

 

Московский семинар по биоинформатике - 4 февраля 2013

Автор: Administrator

Понедельник, 4 февраля 2013, 18.00
МГУ, Лаб. корпус Б (факультет биоинженерии и биоинформатики), к. 221.


Сергей Нуждин
Университет Южной Калифорнии, США

Population Genetics + Systems Biology = Personalized Medicine?

   

Страница 2 из 6