Сервисы

Rosalind - обучение биоинформатике с помошью решения задач

Обновлено 18.08.2012

Бесплатная платформа для обучение биоинформатике с помощью решения задач - http://rosalind.info.

Для задач приведена строгая формулировка и биологическое обоснование.

Для того, чтобы решать задачи нет необходимости быть специалистом в биологии. Для каждой задачи приводится достаточно данных для её решения.

 

Bri-shur.com

Обновлено 09.02.2011 Автор: Administrator

    Мы хотели бы представить для российского научного сообщества новый сайт с некоторыми популярными сервисами по биоинформатике - http://bri-shur.com. Среди используемых алгоритмов - как оригинальные разработки группы Genebee так и другие адаптированные открытые программы.

     Сервисы включают скрининг по гомологии, множественное выравнивание, скрининг по регулярному выражению, филогенетический анализ, гомологичное моделирование, некоторые полезные утилиты, а так же собственную поисковую систему по базе Medline.

 

StatBase - бесплатная программа для статистических расчетов (версия 2.5.4)

Обновлено 08.10.2012 Автор: Administrator

StatBase - бесплатная программа для статистических расчетов. Отличие от других пакетов - оригинальные методы анализа данных (автоматический подбор наилучшего уравнения нелинейной регрессии, подбор вида распределения, оценка соответствующих параметров и доверительных интервалов и т.д.), удобное формирование подвыборок, используя язык SQL.

UPD: Последняя версия - 2.5.4

   

Сегментация одномерных гистограмм

Обновлено 23.06.2009 Автор: Administrator

Бесплатная библиотека для статистически мотивированной сегментации гистограмм (поиск пиков)

 

Count composition of n-mer words in a sequence with p-value estimation

Обновлено 09.03.2009 Автор: Administrator

Simple online service to count the number of distinct n-mers in a sequence. Pretty like compseq program from EMBOSS, but also estimates significance of difference between observed and expected frequences.