Обновлено 10.09.2012 Автор: Administrator
Обновляемый небольшой путеводитель по сайту - краткий обзор наиболее интересных материалов.
Многие страницы на сайте - это короткие заметки по одному вопросу. Не судите строго если что-то показалось общеизвестным/скучным, лучше помогите сделать лучше :) Буду рад, если в комментариях или на форуме поделитесь своими соображениями/вопросами по поводу любой заметки на сайте. Есть желание - присылайте свои статьи, будет здорово если удасться создать сайт для людей занимающихся вычислительной биологией в России.
Биоинформатикам стоит взглянут на соответствующий раздел, но в первую очередь будет, наверное, интересно обсуждение хороших книг по биоинформатике, также попытка обозреть существующую литературу на русском языке. Обсуждаются проблемы интеграции Perl и R. Можно посмотреть некоторые мысли по поводу повседневных задач биоинформатика-разработчика. Выложены лекции И.И. Артамоновой в рамках спецкурса по биоинформатике для студентов биологического факультета МГУ.
Для программирования на Perl можно посмотреть способ печати сложных структур - очень помогает при отладке. Есть небольшая заметка по поводу написания многопоточных Perl-скриптов под windows. Также рекомендую ознакомится с начальными главами книги Лу Гринзоу "Философия программирования Windows 95".
В разделе Анализ данных можно найти сведения о примении языка R. Например - отладка и сборник нескольких полезных функций и пакетов. Есть обзор методов разведочного анализа и распознавания образов на примере данных масс-спектрометрии (с этим мне приходится часто сталкиваться). Также есть черновые записи по кластерному анализу (часть 1 , часть 2).
Открыт раздел Сервисы , где можно посчитать частоты встречаемости подпоследовальностей заданной длинны и оценить их статистическую значимость, а также скачать свободно распространяемую библиотеку для сегментации одномерных гистограмм. Часто посетителей интересует бесплатная программа для статистических расчетов - StatBase.
Представлены обучающие материалы про использование формулы Байеса в статистике, оценку вероятности события по частоте, большая статья о расстоянии Пирсона хи-квадрат.
Поддерживается коллекция ссылок на сайты по биоинформатике, статистике, электронным библиотекам, обработке изображений и т.д.
В разделе Ресурсы можно прочитать краткие рецензии интересных, на мой взгляд, книг. В некоторых случаях выложены и сами книги.
В планах - небольшой обзор возможностей BioPerl как главного помощника любителей Perl и биоинформатики и заметка про интерактивную графику в R.
| < Предыдущая | Следующая > |
|---|
