Ссылки на программы и полезные сайты для биоинформатиков.
| № | Веб-ссылка | Хиты |
|---|---|---|
| 1 |
BioStar - вопросы и ответы по биоинформатике и геномике Сайт, где можно задавать вопросы (и получать ответы) по биоинформатике, вычислительной геномике и системной биологии и т.д. Регистрироваться необязательно. Как пишут в FAQ - no question is too trivial or too "newbie". |
2574 |
| 2 |
Mobyle@Pasteur Набор онлайн-сервисов для задач биоинформатики (выравнивание, филогения, поиск мотивов, определение генов, CpG и т.д.). Объемные вычисления могут быть запущены на сервере на длительный срок, результаты придут по почте. |
2112 |
| 3 |
Dealing with phylogenetic trees - a \"comprehensive list\" Ссылки с описаниями на ~50 программ для работы с филогенетическими деревьями. |
2508 |
| 4 |
Bio++ Набор библиотек на С++. Реализованы работа с сиквенсами, построение филогенетических деревьев, модели замен, популяционная генетика, численные методы. |
2624 |
| 5 |
Bioinformatics.fr Большая коллекция ссылок на всевозможные ресурсы по биоинформатике - вакансии, компании, журналы, блоги, книги, конференции, лаборатории и т.д. |
2482 |
| 6 |
Biopieces Набор относительно простых утилит командной строки для работы с последовательностями. Решать разнообразные задачи можно путем комбинирования вызовов утилит. Функциональность примерно равна таковой у EMBOSS, но работает только в Unix. |
2195 |
| 7 |
Interactive Tree of Life |
2630 |
| 8 |
Computational Biology News Blog Блог о вычислительной биологии. Много новостей, но на мой взгляд Bioinformatics Zen поинтереснее будет. |
2682 |
| 9 |
Bioinformatics Zen Блог для биоинформатиков-разработчиков. Попадаются весьма интересные моменты, рекомендую. |
2359 |
| 10 |
meta Microbes Online.org Сайт о геномике прокариот. Более 3500 геномов. Информация о генах, гомологах, доменах, филогенетика и т.д. Для разработчиков есть доступ к SQL-серверу. Можно легко решать такие задачи как, например, получить upstream 500 nt для каждого гена, с учетом перекрытий генов. |
1622 |
| 11 |
The G6G Directory of Omics and Intelligent Software Большой каталог с описанием существующих программ для анализа omics-данных. Акцент на софт для data-mining в биотехнологии, использующего искусственный интеллект. |
1772 |
| 12 |
mybiosoftware.com Каталог свободного программного обеспечения для биоинформатики. Есть деление на категории, облако тегов |
1847 |
